Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VdrP48281 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VdrP48281 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VdrP48281 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VdrP48281 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VdrP48281 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VdrP48281 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VdrP48281 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VdrP48281 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VdrP48281 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VdrP48281 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VdrP48281 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VdrP48281 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VdrP48281 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VdrP48281 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VdrP48281 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VdrP48281 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VdrP48281 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VdrP48281 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VdrP48281 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VdrP48281 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VdrP48281 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VdrP48281 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VdrP48281 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VdrP48281 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VdrP48281 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VdrP48281 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VdrP48281 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VdrP48281 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VdrP48281 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VdrP48281 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VdrP48281 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VdrP48281 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VdrP48281 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VdrP48281 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VdrP48281 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VdrP48281 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VdrP48281 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VdrP48281 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VdrP48281 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VdrP48281 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VdrP48281 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VdrP48281 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VdrP48281 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VdrP48281 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VdrP48281 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VdrP48281 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VdrP48281 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VdrP48281 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VdrP48281 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VdrP48281 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VdrP48281 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VdrP48281 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VdrP48281 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VdrP48281 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VdrP48281 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VdrP48281 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VdrP48281 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VdrP48281 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VdrP48281 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VdrP48281 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VdrP48281 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VdrP48281 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VdrP48281 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VdrP48281 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VdrP48281 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VdrP48281 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VdrP48281 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VdrP48281 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VdrP48281 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VdrP48281 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VdrP48281 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VdrP48281 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VdrP48281 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VdrP48281 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VdrP48281 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VdrP48281 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VdrP48281 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VdrP48281 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VdrP48281 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VdrP48281 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VdrP48281 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VdrP48281 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VdrP48281 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VdrP48281 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VdrP48281 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VdrP48281 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VdrP48281 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VdrP48281 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VdrP48281 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VdrP48281 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VdrP48281 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VdrP48281 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VdrP48281 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VdrP48281 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VdrP48281 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VdrP48281 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VdrP48281 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VdrP48281 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VdrP48281 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms