Protein–RNA interactions for Protein: P46735

Myo1b, Unconventional myosin-Ib, mousemouse

Predictions only

Length 1,107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1bP46735 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Myo1bP46735 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Myo1bP46735 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Myo1bP46735 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Myo1bP46735 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Myo1bP46735 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Myo1bP46735 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Myo1bP46735 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Myo1bP46735 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Myo1bP46735 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Myo1bP46735 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Myo1bP46735 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Myo1bP46735 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Myo1bP46735 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Myo1bP46735 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Myo1bP46735 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Myo1bP46735 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Myo1bP46735 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Myo1bP46735 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Myo1bP46735 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Myo1bP46735 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Myo1bP46735 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Myo1bP46735 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Myo1bP46735 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Myo1bP46735 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Myo1bP46735 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Myo1bP46735 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Myo1bP46735 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Myo1bP46735 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Myo1bP46735 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Myo1bP46735 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Myo1bP46735 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Myo1bP46735 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Myo1bP46735 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Myo1bP46735 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Myo1bP46735 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Myo1bP46735 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Myo1bP46735 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Myo1bP46735 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Myo1bP46735 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Myo1bP46735 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Myo1bP46735 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Myo1bP46735 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Myo1bP46735 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Myo1bP46735 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Myo1bP46735 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Myo1bP46735 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Myo1bP46735 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Myo1bP46735 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Myo1bP46735 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Myo1bP46735 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Myo1bP46735 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Myo1bP46735 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Myo1bP46735 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Myo1bP46735 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Myo1bP46735 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Myo1bP46735 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Myo1bP46735 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Myo1bP46735 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Myo1bP46735 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Myo1bP46735 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Myo1bP46735 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Myo1bP46735 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Myo1bP46735 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Myo1bP46735 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Myo1bP46735 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Myo1bP46735 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Myo1bP46735 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Myo1bP46735 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Myo1bP46735 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Myo1bP46735 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Myo1bP46735 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Myo1bP46735 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Myo1bP46735 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Myo1bP46735 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Myo1bP46735 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Myo1bP46735 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Myo1bP46735 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Myo1bP46735 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Myo1bP46735 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Myo1bP46735 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Myo1bP46735 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Myo1bP46735 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Myo1bP46735 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Myo1bP46735 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Myo1bP46735 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Myo1bP46735 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Myo1bP46735 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Myo1bP46735 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Myo1bP46735 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Myo1bP46735 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Myo1bP46735 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Myo1bP46735 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Myo1bP46735 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Myo1bP46735 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Myo1bP46735 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Myo1bP46735 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Myo1bP46735 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Myo1bP46735 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Myo1bP46735 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms