Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf1P46099 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf1P46099 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf1P46099 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klf1P46099 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf1P46099 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf1P46099 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf1P46099 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf1P46099 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms