Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ItgavP43406 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ItgavP43406 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ItgavP43406 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ItgavP43406 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ItgavP43406 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ItgavP43406 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ItgavP43406 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms