Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin1P35438 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin1P35438 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin1P35438 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin1P35438 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Grin1P35438 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms