Protein–RNA interactions for Protein: P35329

Cd22, B-cell receptor CD22, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd22P35329 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd22P35329 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd22P35329 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd22P35329 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd22P35329 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd22P35329 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd22P35329 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd22P35329 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd22P35329 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd22P35329 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd22P35329 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd22P35329 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd22P35329 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms