Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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