Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms