Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms