Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms