Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfraP26618 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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