Protein–RNA interactions for Protein: P25976

Ubtf, Nucleolar transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbtfP25976 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UbtfP25976 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UbtfP25976 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UbtfP25976 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UbtfP25976 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UbtfP25976 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UbtfP25976 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UbtfP25976 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UbtfP25976 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms