Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd247P24161 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd247P24161 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd247P24161 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd247P24161 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd247P24161 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd247P24161 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd247P24161 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd247P24161 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.3 ms