Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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