Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pou5f1P20263 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pou5f1P20263 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms