Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms