Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18532 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18532 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18532 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18532 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18532 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18532 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18532 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P18532 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18532 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18532 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18532 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18532 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18532 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18532 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18532 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18532 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18532 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18532 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18532 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18532 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18532 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18532 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18532 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18532 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18532 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18532 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18532 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18532 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18532 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P18532 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18532 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18532 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18532 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18532 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18532 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18532 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18532 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18532 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18532 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18532 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18532 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18532 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18532 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18532 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18532 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18532 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18532 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18532 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18532 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18532 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18532 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18532 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18532 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18532 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18532 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18532 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18532 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18532 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18532 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18532 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18532 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18532 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18532 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18532 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18532 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18532 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
P18532 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
P18532 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
P18532 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
P18532 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
P18532 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18532 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18532 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18532 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18532 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
P18532 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18532 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18532 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18532 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18532 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18532 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18532 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18532 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18532 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18532 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18532 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18532 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18532 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18532 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18532 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18532 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18532 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18532 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18532 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18532 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18532 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18532 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18532 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18532 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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