Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
P18528 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18528 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18528 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18528 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18528 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18528 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18528 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18528 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18528 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18528 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18528 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
P18528 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18528 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18528 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18528 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18528 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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P18528 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18528 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18528 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18528 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18528 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18528 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18528 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18528 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18528 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18528 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18528 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18528 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18528 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18528 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18528 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18528 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18528 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18528 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18528 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18528 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18528 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18528 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18528 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18528 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18528 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
P18528 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18528 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18528 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18528 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18528 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18528 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18528 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18528 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18528 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18528 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18528 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18528 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18528 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18528 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
P18528 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18528 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18528 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18528 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18528 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18528 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18528 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18528 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18528 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18528 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18528 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18528 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18528 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18528 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18528 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
P18528 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18528 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18528 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
P18528 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18528 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
P18528 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
P18528 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18528 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18528 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18528 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18528 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18528 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18528 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
P18528 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P18528 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P18528 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P18528 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
P18528 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P18528 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P18528 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P18528 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P18528 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P18528 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18528 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18528 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18528 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18528 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18528 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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