Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PtpraP18052 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PtpraP18052 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtpraP18052 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtpraP18052 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtpraP18052 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpraP18052 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpraP18052 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpraP18052 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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