Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

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Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou4f1P17208 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pou4f1P17208 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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