Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

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Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfb3P17125 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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