Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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