Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhoP15409 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhoP15409 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RhoP15409 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhoP15409 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhoP15409 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhoP15409 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhoP15409 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhoP15409 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhoP15409 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RhoP15409 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RhoP15409 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RhoP15409 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RhoP15409 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RhoP15409 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RhoP15409 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RhoP15409 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RhoP15409 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RhoP15409 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RhoP15409 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RhoP15409 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RhoP15409 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RhoP15409 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RhoP15409 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RhoP15409 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RhoP15409 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RhoP15409 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RhoP15409 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RhoP15409 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RhoP15409 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RhoP15409 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RhoP15409 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RhoP15409 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RhoP15409 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RhoP15409 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RhoP15409 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RhoP15409 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RhoP15409 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RhoP15409 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RhoP15409 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RhoP15409 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RhoP15409 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RhoP15409 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RhoP15409 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RhoP15409 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RhoP15409 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RhoP15409 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RhoP15409 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RhoP15409 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RhoP15409 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RhoP15409 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RhoP15409 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RhoP15409 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RhoP15409 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RhoP15409 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RhoP15409 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RhoP15409 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RhoP15409 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RhoP15409 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RhoP15409 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RhoP15409 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RhoP15409 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RhoP15409 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RhoP15409 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RhoP15409 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RhoP15409 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RhoP15409 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RhoP15409 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RhoP15409 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RhoP15409 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RhoP15409 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RhoP15409 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RhoP15409 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RhoP15409 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RhoP15409 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RhoP15409 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RhoP15409 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RhoP15409 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RhoP15409 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RhoP15409 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RhoP15409 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RhoP15409 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RhoP15409 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RhoP15409 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RhoP15409 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RhoP15409 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RhoP15409 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RhoP15409 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RhoP15409 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RhoP15409 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RhoP15409 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RhoP15409 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RhoP15409 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RhoP15409 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RhoP15409 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RhoP15409 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RhoP15409 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RhoP15409 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RhoP15409 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RhoP15409 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms