Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nr4a1P12813 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nr4a1P12813 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nr4a1P12813 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nr4a1P12813 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nr4a1P12813 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nr4a1P12813 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nr4a1P12813 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nr4a1P12813 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nr4a1P12813 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nr4a1P12813 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nr4a1P12813 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nr4a1P12813 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nr4a1P12813 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nr4a1P12813 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nr4a1P12813 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nr4a1P12813 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nr4a1P12813 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nr4a1P12813 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nr4a1P12813 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nr4a1P12813 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nr4a1P12813 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms