Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prf1P10820 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prf1P10820 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prf1P10820 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prf1P10820 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prf1P10820 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prf1P10820 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prf1P10820 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prf1P10820 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms