Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

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Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PolP10400 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PolP10400 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PolP10400 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PolP10400 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PolP10400 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PolP10400 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PolP10400 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PolP10400 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PolP10400 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PolP10400 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PolP10400 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PolP10400 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PolP10400 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PolP10400 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PolP10400 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PolP10400 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PolP10400 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PolP10400 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PolP10400 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PolP10400 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PolP10400 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PolP10400 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PolP10400 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PolP10400 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PolP10400 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PolP10400 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PolP10400 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PolP10400 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PolP10400 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PolP10400 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PolP10400 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PolP10400 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PolP10400 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PolP10400 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PolP10400 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PolP10400 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PolP10400 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PolP10400 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PolP10400 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PolP10400 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PolP10400 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
PolP10400 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
PolP10400 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PolP10400 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
PolP10400 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
PolP10400 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PolP10400 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PolP10400 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PolP10400 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PolP10400 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PolP10400 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PolP10400 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PolP10400 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PolP10400 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PolP10400 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PolP10400 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PolP10400 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PolP10400 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PolP10400 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PolP10400 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PolP10400 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PolP10400 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PolP10400 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PolP10400 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PolP10400 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PolP10400 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PolP10400 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PolP10400 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PolP10400 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PolP10400 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PolP10400 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PolP10400 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PolP10400 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PolP10400 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PolP10400 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PolP10400 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PolP10400 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PolP10400 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PolP10400 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PolP10400 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PolP10400 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PolP10400 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PolP10400 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PolP10400 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PolP10400 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PolP10400 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PolP10400 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PolP10400 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PolP10400 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PolP10400 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PolP10400 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PolP10400 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PolP10400 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PolP10400 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PolP10400 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PolP10400 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PolP10400 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PolP10400 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PolP10400 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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