Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Schip1P0DPB4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms