Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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