Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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