Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtrP07309 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtrP07309 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtrP07309 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtrP07309 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtrP07309 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtrP07309 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtrP07309 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtrP07309 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtrP07309 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtrP07309 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtrP07309 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtrP07309 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtrP07309 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtrP07309 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtrP07309 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtrP07309 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtrP07309 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtrP07309 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtrP07309 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtrP07309 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtrP07309 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtrP07309 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtrP07309 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtrP07309 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtrP07309 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtrP07309 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtrP07309 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtrP07309 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtrP07309 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtrP07309 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtrP07309 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
TtrP07309 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtrP07309 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtrP07309 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtrP07309 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
TtrP07309 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtrP07309 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtrP07309 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtrP07309 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtrP07309 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtrP07309 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtrP07309 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtrP07309 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtrP07309 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
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TtrP07309 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtrP07309 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtrP07309 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtrP07309 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtrP07309 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
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TtrP07309 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtrP07309 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtrP07309 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TtrP07309 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TtrP07309 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TtrP07309 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TtrP07309 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TtrP07309 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TtrP07309 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TtrP07309 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TtrP07309 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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TtrP07309 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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TtrP07309 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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TtrP07309 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TtrP07309 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TtrP07309 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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TtrP07309 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TtrP07309 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TtrP07309 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TtrP07309 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TtrP07309 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TtrP07309 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TtrP07309 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TtrP07309 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TtrP07309 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TtrP07309 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TtrP07309 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TtrP07309 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TtrP07309 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TtrP07309 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TtrP07309 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TtrP07309 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TtrP07309 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TtrP07309 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TtrP07309 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TtrP07309 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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