Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04214 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04214 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04214 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04214 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04214 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04214 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04214 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04214 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04214 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04214 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04214 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04214 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04214 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04214 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P04214 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04214 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04214 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04214 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04214 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04214 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04214 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04214 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04214 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04214 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04214 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04214 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04214 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04214 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04214 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04214 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P04214 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P04214 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P04214 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P04214 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P04214 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P04214 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P04214 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P04214 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P04214 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P04214 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P04214 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P04214 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P04214 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P04214 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P04214 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P04214 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P04214 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P04214 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P04214 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P04214 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P04214 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P04214 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P04214 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P04214 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P04214 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P04214 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P04214 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P04214 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P04214 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P04214 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P04214 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P04214 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P04214 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P04214 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P04214 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P04214 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P04214 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P04214 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P04214 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P04214 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P04214 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P04214 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P04214 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P04214 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P04214 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P04214 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P04214 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P04214 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P04214 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P04214 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P04214 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P04214 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P04214 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P04214 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P04214 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P04214 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P04214 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P04214 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P04214 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P04214 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P04214 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P04214 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P04214 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P04214 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P04214 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P04214 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P04214 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P04214 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P04214 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms