Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ccl20O89093 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ccl20O89093 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ccl20O89093 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ccl20O89093 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ccl20O89093 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl20O89093 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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