Protein–RNA interactions for Protein: O70340

Nptx2, Neuronal pentraxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx2O70340 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms