Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrxO55103 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrxO55103 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrxO55103 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrxO55103 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrxO55103 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrxO55103 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrxO55103 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrxO55103 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrxO55103 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrxO55103 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrxO55103 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrxO55103 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrxO55103 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrxO55103 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrxO55103 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrxO55103 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrxO55103 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrxO55103 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrxO55103 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrxO55103 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrxO55103 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrxO55103 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrxO55103 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrxO55103 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrxO55103 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PrxO55103 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrxO55103 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrxO55103 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrxO55103 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PrxO55103 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrxO55103 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrxO55103 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrxO55103 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrxO55103 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrxO55103 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PrxO55103 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
PrxO55103 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PrxO55103 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PrxO55103 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PrxO55103 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PrxO55103 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrxO55103 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrxO55103 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrxO55103 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrxO55103 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrxO55103 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrxO55103 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrxO55103 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrxO55103 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PrxO55103 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PrxO55103 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PrxO55103 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrxO55103 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrxO55103 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrxO55103 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrxO55103 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrxO55103 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PrxO55103 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrxO55103 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrxO55103 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrxO55103 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrxO55103 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrxO55103 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrxO55103 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrxO55103 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrxO55103 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrxO55103 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrxO55103 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PrxO55103 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrxO55103 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PrxO55103 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrxO55103 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PrxO55103 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrxO55103 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrxO55103 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PrxO55103 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrxO55103 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrxO55103 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrxO55103 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrxO55103 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrxO55103 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrxO55103 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrxO55103 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrxO55103 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrxO55103 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrxO55103 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrxO55103 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrxO55103 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PrxO55103 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PrxO55103 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrxO55103 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrxO55103 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrxO55103 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PrxO55103 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PrxO55103 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrxO55103 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrxO55103 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PrxO55103 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrxO55103 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms