Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms