Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SlkO54988 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SlkO54988 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SlkO54988 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SlkO54988 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SlkO54988 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SlkO54988 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SlkO54988 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SlkO54988 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SlkO54988 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SlkO54988 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SlkO54988 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SlkO54988 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SlkO54988 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SlkO54988 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SlkO54988 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SlkO54988 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SlkO54988 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SlkO54988 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SlkO54988 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SlkO54988 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SlkO54988 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SlkO54988 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SlkO54988 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SlkO54988 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SlkO54988 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SlkO54988 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SlkO54988 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SlkO54988 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SlkO54988 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SlkO54988 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SlkO54988 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SlkO54988 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SlkO54988 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SlkO54988 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SlkO54988 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SlkO54988 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SlkO54988 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SlkO54988 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SlkO54988 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SlkO54988 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SlkO54988 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SlkO54988 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SlkO54988 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SlkO54988 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SlkO54988 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SlkO54988 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SlkO54988 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SlkO54988 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SlkO54988 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SlkO54988 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SlkO54988 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SlkO54988 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SlkO54988 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SlkO54988 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SlkO54988 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SlkO54988 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SlkO54988 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SlkO54988 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SlkO54988 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SlkO54988 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SlkO54988 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SlkO54988 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SlkO54988 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SlkO54988 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SlkO54988 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SlkO54988 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SlkO54988 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SlkO54988 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SlkO54988 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SlkO54988 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SlkO54988 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SlkO54988 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SlkO54988 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SlkO54988 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SlkO54988 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SlkO54988 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SlkO54988 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SlkO54988 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SlkO54988 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SlkO54988 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SlkO54988 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SlkO54988 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SlkO54988 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SlkO54988 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SlkO54988 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SlkO54988 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SlkO54988 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SlkO54988 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SlkO54988 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SlkO54988 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SlkO54988 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SlkO54988 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SlkO54988 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SlkO54988 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SlkO54988 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SlkO54988 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SlkO54988 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SlkO54988 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SlkO54988 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms