Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf9O35739 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf9O35739 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
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Klf9O35739 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Klf9O35739 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Klf9O35739 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Klf9O35739 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf9O35739 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Klf9O35739 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf9O35739 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Klf9O35739 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Klf9O35739 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Klf9O35739 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf9O35739 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Klf9O35739 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf9O35739 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf9O35739 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms