Protein–RNA interactions for Protein: O35690

Phox2b, Paired mesoderm homeobox protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2bO35690 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Phox2bO35690 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Phox2bO35690 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Phox2bO35690 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Phox2bO35690 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phox2bO35690 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phox2bO35690 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Phox2bO35690 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phox2bO35690 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phox2bO35690 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phox2bO35690 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Phox2bO35690 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phox2bO35690 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phox2bO35690 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phox2bO35690 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phox2bO35690 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phox2bO35690 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phox2bO35690 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phox2bO35690 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Phox2bO35690 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.06■□□□□ 0
Phox2bO35690 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phox2bO35690 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phox2bO35690 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Phox2bO35690 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Phox2bO35690 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Phox2bO35690 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Phox2bO35690 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Phox2bO35690 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Phox2bO35690 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phox2bO35690 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Phox2bO35690 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Phox2bO35690 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phox2bO35690 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Phox2bO35690 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Phox2bO35690 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Phox2bO35690 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Phox2bO35690 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phox2bO35690 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phox2bO35690 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phox2bO35690 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phox2bO35690 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phox2bO35690 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phox2bO35690 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phox2bO35690 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phox2bO35690 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phox2bO35690 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phox2bO35690 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Phox2bO35690 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phox2bO35690 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phox2bO35690 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phox2bO35690 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Phox2bO35690 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Phox2bO35690 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Phox2bO35690 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Phox2bO35690 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Phox2bO35690 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Phox2bO35690 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phox2bO35690 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Phox2bO35690 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phox2bO35690 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phox2bO35690 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phox2bO35690 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Phox2bO35690 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phox2bO35690 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phox2bO35690 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Phox2bO35690 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phox2bO35690 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phox2bO35690 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Phox2bO35690 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phox2bO35690 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phox2bO35690 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phox2bO35690 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phox2bO35690 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phox2bO35690 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phox2bO35690 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phox2bO35690 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Phox2bO35690 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Phox2bO35690 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Phox2bO35690 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phox2bO35690 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Phox2bO35690 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phox2bO35690 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phox2bO35690 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phox2bO35690 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phox2bO35690 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Phox2bO35690 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phox2bO35690 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Phox2bO35690 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Phox2bO35690 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phox2bO35690 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phox2bO35690 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phox2bO35690 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phox2bO35690 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phox2bO35690 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phox2bO35690 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Phox2bO35690 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phox2bO35690 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phox2bO35690 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phox2bO35690 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phox2bO35690 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms