Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Opn1mwO35599 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Opn1mwO35599 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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