Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt1O35449 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms