Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms