Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
KeraO35367 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
KeraO35367 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
KeraO35367 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
KeraO35367 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
KeraO35367 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
KeraO35367 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
KeraO35367 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
KeraO35367 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
KeraO35367 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
KeraO35367 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
KeraO35367 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
KeraO35367 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
KeraO35367 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
KeraO35367 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
KeraO35367 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
KeraO35367 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
KeraO35367 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
KeraO35367 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
KeraO35367 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
KeraO35367 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
KeraO35367 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
KeraO35367 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
KeraO35367 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
KeraO35367 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
KeraO35367 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
KeraO35367 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
KeraO35367 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
KeraO35367 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
KeraO35367 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
KeraO35367 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
KeraO35367 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
KeraO35367 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
KeraO35367 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
KeraO35367 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
KeraO35367 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
KeraO35367 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
KeraO35367 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
KeraO35367 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
KeraO35367 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
KeraO35367 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
KeraO35367 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
KeraO35367 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
KeraO35367 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
KeraO35367 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
KeraO35367 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
KeraO35367 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
KeraO35367 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
KeraO35367 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
KeraO35367 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
KeraO35367 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
KeraO35367 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
KeraO35367 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
KeraO35367 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
KeraO35367 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
KeraO35367 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
KeraO35367 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
KeraO35367 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
KeraO35367 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
KeraO35367 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
KeraO35367 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KeraO35367 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KeraO35367 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KeraO35367 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KeraO35367 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
KeraO35367 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KeraO35367 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KeraO35367 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KeraO35367 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KeraO35367 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KeraO35367 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KeraO35367 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
KeraO35367 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KeraO35367 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
KeraO35367 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KeraO35367 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
KeraO35367 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KeraO35367 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KeraO35367 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KeraO35367 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KeraO35367 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KeraO35367 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KeraO35367 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KeraO35367 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KeraO35367 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KeraO35367 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KeraO35367 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KeraO35367 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KeraO35367 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KeraO35367 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KeraO35367 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KeraO35367 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KeraO35367 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KeraO35367 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KeraO35367 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KeraO35367 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KeraO35367 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KeraO35367 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
KeraO35367 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KeraO35367 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms