Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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H2-Q1O19441 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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H2-Q1O19441 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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H2-Q1O19441 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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H2-Q1O19441 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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H2-Q1O19441 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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H2-Q1O19441 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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H2-Q1O19441 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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H2-Q1O19441 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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H2-Q1O19441 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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H2-Q1O19441 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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H2-Q1O19441 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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H2-Q1O19441 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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