Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema3aO08665 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sema3aO08665 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema3aO08665 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema3aO08665 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sema3aO08665 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sema3aO08665 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema3aO08665 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sema3aO08665 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sema3aO08665 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema3aO08665 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sema3aO08665 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema3aO08665 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sema3aO08665 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema3aO08665 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema3aO08665 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema3aO08665 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema3aO08665 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema3aO08665 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema3aO08665 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema3aO08665 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema3aO08665 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sema3aO08665 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema3aO08665 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema3aO08665 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sema3aO08665 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3aO08665 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3aO08665 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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