Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 5430403N17Rik-201ENSMUST00000210717 2553 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
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Gm21887J3QQ04 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Selenof-202ENSMUST00000106211 1178 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
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Gm21887J3QQ04 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
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Gm21887J3QQ04 Oaz3-201ENSMUST00000191506 732 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
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Gm21887J3QQ04 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
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Gm21887J3QQ04 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Olfr1102-201ENSMUST00000055129 1063 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
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Gm21887J3QQ04 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
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Gm21887J3QQ04 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
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Gm21887J3QQ04 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
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Gm21887J3QQ04 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
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Gm21887J3QQ04 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
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Gm21887J3QQ04 Gm43750-201ENSMUST00000199027 2493 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Sec61g-202ENSMUST00000109642 691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
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