Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Top6blJ3QMY9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Top6blJ3QMY9 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Top6blJ3QMY9 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Top6blJ3QMY9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Top6blJ3QMY9 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Top6blJ3QMY9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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Top6blJ3QMY9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Top6blJ3QMY9 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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Top6blJ3QMY9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Top6blJ3QMY9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Top6blJ3QMY9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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