Protein–RNA interactions for Protein: J3QMM8

Gm7971, Predicted gene 16429, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7971J3QMM8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms