Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms