Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pabpc4lG5E8X2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pabpc4lG5E8X2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pabpc4lG5E8X2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pabpc4lG5E8X2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pabpc4lG5E8X2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Pabpc4lG5E8X2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pabpc4lG5E8X2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc4lG5E8X2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc4lG5E8X2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc4lG5E8X2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc4lG5E8X2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc4lG5E8X2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc4lG5E8X2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc4lG5E8X2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms