Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms